咖啡碱的变化 咖啡碱是茶叶中主要的嘌呤碱，是构成茶汤的重要滋味物质，与普洱茶品质呈正相关，相关系数为0.879。研究表明，咖啡碱在普洱茶渥堆过程中呈增加趋势，第五翻茶坯的咖啡碱含量较原料增幅25.5%。有关咖啡碱增加的机理有待进一步的研究。

氨基酸的变化 氨基酸是构成绿茶品质尤其是绿茶茶汤滋味的重要化学成分，能增强茶叶的鲜爽味。氨基酸在普洱茶发酵的特殊温湿条件下发生氧化、降解和转化，与多酚类起反应生成褐色色素，因此在普洱茶渥堆发酵过程中氨基酸总体呈减少趋势，第五翻混合茶坯仅含氨基酸0.56%，较晒青原料的1.13%减幅50.44%，其中上层茶坯的氨基酸减幅较大。

在普洱茶的渥堆发酵过程中，茶坯的儿茶素、茶红素、水溶性糖、氨基酸、茶多酚和水浸出物的含量均减少，而茶褐素、水溶性果胶、茶黄素和咖啡碱的含量则增加；其中儿茶素、茶红素减少较明显，而茶褐素、水溶性果胶则增加较多。这些物质的综合变化，使茶汤的滋味由渥堆发酵前的浓强变为醇厚，汤色由黄绿变为红褐，形成普洱茶特有的滋味、汤色品质风格。

在普洱茶的渥堆发酵中，由于不同层次的茶坯所着生的微生物及堆温、含水率的差异，导致不同层次的茶坯的化学成分变化快慢不一：上层变化幅度最大，中层次之、下层变化幅度最小。因此，增加设施，改进工艺，完全可提高发酵均匀度、加快发酵速度，有利稳定品质，缩短渥堆发酵周期，提高资金周转利用率，保障普洱茶健康发展。