湿热作用和自动氧化作用也是贯穿陈化过程的主要因素。在陈化过程的中，茶叶吸潮氧化包裹其中，春夏秋冬的天气变化都会使茶叶中的活性成分发生氧化、分解以及产生新的聚合，主要表现在多酚类物质氧化、蛋白质的降解，香气组分的变化等，通过这些变化，一方面使茶品的口感愈显平和、陈香味突出，汤色变深浓，另一方面这些氧化后的小分子化合物湖新的聚合物可能被微生物利用，或者微生物的代谢产物与之聚合产生新的聚合产物。这一系列变化是相当复杂的，也许人类目前的科技水平和科技手段还很难分离。随着科技的进步，相信在不久的将来，这些秘密都将水落石出。

但人们必须坚信一点，茶毕竟是茶，黑茶就是黑茶。人类在对它进行科学分析的同时，必须尊重这一客观事实，茶是大自然产物（包括茯砖以及茯砖里所生成的冠突散囊菌），是一个有机的整体，离开整体而进行片面的分析也许只能带来片面的结论，为什么中医理论经久不衰，洋人为什么对中草药还情有独钟？随着科技的发展，这些困惑都将得到解答，人类在不断的探索自然界的奥妙的同时，切不要忘了维生素片是取代不了蔬菜和水果的。

人们担心，在黑茶存放过程中会不会存在有害微生物？喝黑茶有没有毒？根据温琼英对茯砖茶的动物安全试验结果表明，按成年人每年服茶5千克的剂量喂养小白鼠，没有发现肝细胞中毒现象，而且试验组比对照组有更强的疾病抵抗力和免疫力。足以证明饮用发展是安全的。普洱茶与黑茶存放过程有相似之处，西南农业大学刘勤晋用普洱茶茶汤进行小白鼠急性中毒试验，也证明喝普洱茶是安全的。台湾大学孙璐西教授报道，在模拟的普洱茶渥堆过程中接种黄曲霉菌，均没检出有黄曲霉菌。这是因为黑茶中含有大量的有益微生物，它们可以抑制有害微生物的生长。这也是黑茶存放过程中霉变（黄曲霉和青霉）情况很少发生的原因，同时也证明，饮用茯砖茶是安全的。

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