因中国大部分产茶区为日本侵略者所占领，茶叶运输不畅，中国茶叶公司与茶商合资，于1943年又在四川荥经县组成荥经藏茶销茶制造厂(又名中和茶厂，该厂1945年停办)。

1944年，中国茶叶公司湖南砖茶厂所制的黑砖茶7280吨运抵兰州，交国民政府财政部贸易委员兰州办事处。其中4000吨远往新疆哈密，用于与苏联的易货贸易，换取我国急需的抗战物资，其余的供应西北边销。

同年，中国茶叶公司因所辖茶区多被日本占领，外销口岸及路线均为日本人所封锁，经国民政府行政院决议撤消停办，中国茶叶公司原机构全部裁并，其资产划归财政部复兴公司。1945年6月2日，中国茶叶公司湖南分公司撤消，业务归复兴公司，中国茶叶公司湖南砖茶厂由复兴公司湖南分公司接管，改名复兴公司湖南砖茶厂。1946年5月l0日，复兴公司裁撤，复兴公司湖南分公司业务移交中央信托局主管，湖南砖茶厂随之更名中央信托局湖南砖茶厂。

1949年10月，中央财政经济委员会于26日至11月11日在北京召开全国茶叶产销会议，中央财政经济委员会副主任薄一波，农业部副部长吴觉农，贸易部副部长姚依林等出席会议，会议决定：在贸易部和农业部的共同领导下，成立国营中国茶叶公司，统一领导中国茶叶产制、运销业务及研究改良事项，总部设在北京。在主要茶叶集散地城市设立分公司，并在主要茶叶产制地区设加工厂，实行自上而下垂直领导。边销茶准许私人经营，但因关系国家的民族政策，国营商业应大力经营。为此，农业部、贸易部11日联合就成立中国茶叶公司向中央财政经济委员会请示报告，并提出在上海、汉口福州设分公司，杭州、屯溪(安徽省内)、安化(属湖南省)、厦门(属福建省)设支公司。11月19日，贸易部部叶季壮、副部长姚依林、沙千里致函农业部副部长吴觉农：中央财政经济委员会巳批准全国茶叶会议报告。23日，中央财政经济委员会主任陈云，副主任薄一波、马寅初签署文件批复成立中国茶叶公司(公司批复为中国茶叶公司，但挂号成立时“叶”改为了“业”，为中国茶业公司)。12月1日，中国茶业公司正式在北京东安门大街29号办公，经理由农业部副部长吴觉农兼任。

1949年8月，湖南和平解放。9月，长沙军管会物资处派军代表着手湖南省茶叶经营管理机构。包括1947年成立的公私合营的湖南省茶业公司和1947年由省财政为主要投资人的公私合营安化茶叶公司，华湘茶厂等。10月，这些企业划交湖南省商业厅土产公司。1950年1月1日，中国茶业公司中南区公司安化支公司在湖南安化县城东坪镇成立，接管湖南平土产公司全部茶叶经营业务和安化茶场。负责安化、新化、桃源、沅陵(以后延至邵阳、武岗)的茶叶收购、加工、销售和出口事项。随后，又成立“中国茶业公司中南区公司长沙联络处”，负责长沙、岳阳、平江、浏阳、湘乡一带的茶叶收购、加工、销售业务。1950年10月，中国茶业公司安化支公司奉命迁往长沙，并与中南区长沙联络处合并，组成中国茶业公司湖南省公司，经营业务和财务核算隶属中国茶业公司，党政关系隶属湖南省商业厅管理。