薛盛堂还说，这片“生态工程区”经过多年运营，确实存在“水位过高、芦苇面积过少、鱼苗投放过多”等“管理问题”，目前已经在积极整改。而在核心区界外，确实也存在历史遗留下来的水产养殖问题，盐城市政府将“积极推动传统养殖方式的转变，逐步建成生态养殖模式，最终达到水产养殖与自然保护‘双赢’的目标”。

　　盐城丹顶鹤保护区湿地面积越来越引起全国各地媒体的广泛关注。近期媒体关于盐城国家级珍禽自然保护区的状况的批评愈来愈多。既有批评核心区内将大面积的湿地改变成鱼塘，对外承包经营，严重影响丹顶鹤等珍禽的生存的报道，还有保护区定点的饭店公然叫卖天鹅肉等网帖广为转贴。盐城市还专门来南京开新闻发布会，对上述报道进行澄清。