首先是农业资源利用不合理，生态环境恶化。由于种种原因，目前黑土地风蚀、水蚀和水土流失都比较严重。总面积大约20多万平方公里的东北黑土地，每年因水土流失造成黑土流失达12亿立方米，黑土层由初开发时的近1米，减少为现在的20－30厘米。由于过度开垦，黑土区耕地比重大，森林覆盖率低，春季多旱多风，夏季又雨量集中，比较容易发生风蚀和水蚀。

　　此外，水土流失使容纳了大量泥沙的水库、河道变成了“地上悬河”，人口的快速增长和耕地面积的不断扩大，土地连续耕作难以休耕补养，使农田耕层变浅，保肥蓄水能力降低，黑土地越种越瘦。其后果是风灾、旱灾、水灾不断，将给农业生产乃至今后的可持续发展带来严重的危害。

　　况且，东北地区目前基础设施还都比较薄弱。一位水利专家表示，目前，整个东北地区的农业基础设施都比较薄弱，装备水平低。从农田基础设施看，现有农田水利工程仍有老化失修的情况，设施不配套，难以发挥应有的作用。

　　气候因素对靠天吃饭的农民可谓是喜忧并存。气候变暖，在中国尤以北方和冬季最为明显。东北则是我国增温最显著的地区之一，其中吉林、黑龙江、内蒙古三省交界区增温趋势最明显。虽然气候变化导致降水量在东北的中南部和北部、东部呈现有减有增的不同趋势，但整体上将加快东北向干旱方面发展。

　　“还应该进一步加大粮食主产区的补偿力度。”陈树韦认为。但是也有专家提出，粮食直接补贴政策会带来一些负面影响。比如农民常年耕种某种作物获得补贴，但很可能会限制种植业结构调整。