东圳库区水土保持生态修复工程，是省水利厅重点示范项目。2004-2008年莆田市共实施8个项目，投资523万元，主要是坡改梯，种草，造林等，使水库水质稳定达标，保证100万人饮水安全。同时，还开展木兰溪、萩芦溪流域水土保持、生态建设以及青山挂白治理等。通过实施“千万亩水土流失治理工程”，莆田市治理水土流失面积30多万亩，使全市的水土流失率下降2.6%，东圳库区下降10%以上，全市环境生态明显改善。

“民以食为天，食以水为本”，莆田市将人民群众的饮水问题放在特别重要的位置上，如总投资6亿元、眼下正在建设中的金钟水利枢纽工程，是个以供水为主，兼及灌溉的大工程，2010年通水后，将惠及仙游、城厢、秀屿、湄洲湾北岸等县区沿海11个乡镇120多万群众和沿线、临港工业，根本解决其生活和生产用水，也为仙游县9个乡镇35万亩耕地、果园提供灌溉保障。截至8月底，已完成2/3以上的工程量。

目前，莆田市正全力推进金种水利枢纽引水配套工程，木兰溪防洪三期荔涵段工程，木兰溪