20世纪90年代初，他开拓了茶园化学生态学研究新领域，从“茶树－害虫－天敌”三重营养关系间的化学通讯机制着手，明确了害虫定位茶树和天敌寻觅害虫的化学生态学机制，揭示了在一种植物上不同害虫诱发产生不同挥发性化合物以引诱各种天敌的现象，为寻求害虫防治新途径提供了理论依据。

　　从20世纪70年代起，陈宗懋院士多次向农业部等部门提出在茶叶中禁用高残留和剧毒农药，选用低毒、高效、低残留农药的建议。1996年和1999年，分别向农业部提出在茶叶生产中禁用高残留的农药品种二氯杀螨醇和氰戊菊酯的建议，得到了农业部、化工部、商业部、卫生部专家的认可和采纳，并分别于1997年6月和1999年11月颁布在全国实施。针对国内出口茶农药大量超标的现状，提出建立生产基地和更换农药品种的建议，并向农业部建议茶叶生产中禁用农药名单，受农业部和各省邀请在各地举办培训班20余次，对降低我国出口茶的农残水平起到了关键作用，超标率由1999年的80%以上降至2006年的17%，得到国际公认和茶业界的好评。