初，地上部秋茶生长转旺，于是根系生长又减弱。10月上旬以后，地上部新梢生长开始进入休眠状态，光照与温度又十分适宜叶片的光合积累，根部养分积累不断增加，加上此时气温仍然适合茶树根系生长，使地下部根系生长达到一年中的生长最高峰。因此，秋茶结束后到小寒之前的这段时间，是广东茶区深翻施肥和进行茶树重修剪或台刈的最佳时期（陈栋，1987）。但是，各地气候条件、土壤种类和茶树品种不同，一年中茶树根系活动状况是有差异的，最佳采茶、施肥与修剪时间也应有所差异。茶树的根系为树体的生长发育起着支持、固定、吸收、贮藏、合成的作用，根系吸收的养分主要是矿质盐类，同时也可以少量缓慢吸收一部分有机物质，它可以从土壤中吸取矿质离子、二氧化碳，输送到叶片中供光合作用等代谢之用。根系也是贮藏有机物质的场所。在茶树进入休眠期之前，施用的铵态氮肥被茶树吸收利用转化成茶氨酸、精氨酸、谷酰胺贮子茶根中，翌年春萌发时再输送到新梢中。夏茶之前追肥施用的镀态氮，能提高根部茶氨酸、精氨酸的累积量，并随新梢的伸长而下降，缓慢被茶树生长所利用。根系也具有合成某些有机物质的能力，如酰胺类，茶叶中的特殊氨基酸——茶氨酸等化学成分大部分是在根系形成的。