目前，该技术的推广主要面临几大问题：需要设备较多，前期一次性投资较大;对管理人员的要求高，需要进行专业培训;由于该技术应用时间较短，设备和专用肥料的市场购买渠道少;长期应用水肥一体化技术，可能会造成湿润区边缘的盐分积累，并对作物造成一定程度的限根效应。

　　尽管如此，水肥一体化技术是农业生产上的一项革命性技术，该项技术不仅可以缓解水资源短缺现状，又节约能源，减少了化肥的使用。实施该项技术后，将节省大量的劳动量和用水，促进了施肥精量化，减轻了土壤板结，保护团粒结构，减少喷药数量和次数，改善了生态环境，经济效益和社会效益可观。