民国初年，溥仪以赏赐等名义，使部分书画名作散失；出宫时还将大批藏品迁离紫禁城，至伪满洲国结束期间，部分藏品失散于民间甚至海外。因此，《石渠宝笈》成为了目前挽救这批失落国宝的最重要的线索。同时，若能验明正身为《石渠宝笈》著录中的画作，往往也会身价倍增，成为拍卖会中的焦点。例如2005年秋季拍卖会，中贸圣佳公司推出的五件《石渠宝笈》著录过的书画，全部成交，而且每件成交价都超过500万元。

　　在鉴别书画的过程中，如《石渠宝笈》这样的文献记载有很高的参考价值。收藏者可以比照著录书中所载的书画题材、名称、质地、尺寸、作者及其款印、后人的各类题识和鉴藏印，以及流传经过等方面内容，弄清楚与该件书画有关的情况，帮助作出正确的判断。通常来说，古代名家、尤其是大名家的作品一般都经过前人鉴藏和著录，如果突然出现一件号称汉晋唐宋名家的作品(出土文物除外)，而各类著录中又并未记载，那十有八九是件伪作。

　　不过，尽信书不如无书，藏家也不可迷信《石渠宝笈》的权威。有专家就曾考证，《石渠宝笈》初编中也著录了部分赝品，如现藏辽宁省博物馆的宋孝宗赵行书《赐周必大手束力》卷、现藏北京故宫博物院的明代徐渭《牡丹》轴。收藏者，尤其是初涉者应该正确对待《石渠宝笈》这样的著录书，既要加以利用，又不能盲目迷信。