考古学家理查德鲍斯沃特说：“我在石头上见到很多非天然的洞孔，这种特征可以与史前的北美洲联系起来。虽然有些参差不齐，但这个孔洞整体相当规则。”鲍斯沃特认为，“神秘石”上的孔洞是用电动工具钻成的，有可能来自19世纪或者20世纪。他说：“我们并没有发现与几百年前的物品相一致的年代变化特征。”

地质学家尤金布戴特也参与了当年的分析工作，据他判断，“神秘石”应该是一种石英岩——由沙岩演化而来，或是糜棱岩——因断层处岩层变化形成的一种纹理细密的层积层。布戴特说，这种类型的岩石在新罕布什尔州并不多见，但不能排除拥有此种资源的可能性。根据他掌握的资料，“神秘石”是独一无二的。“很难判断出它到底来自什么地方。”

布戴特表示发现“神秘石”的故事太过传奇性，这也给研究带来难度。“你根本无法确定这个故事到底是从哪传出来的。很多情节含糊不定……使人极难作出判断。发现过程的来龙去脉有时要比石头本身更为重要。举个例子来说，如果这块石头属于共济会，且上面记录了他们的一些秘密，也就是说外界是很难猜透这些信息的具体含义的。石头上的图案可能是有意义的，但对我们来说，它们只不过是月亮和玉米穗罢了。”

历史学会收藏与展览负责人卫斯理巴拉表示，寻找类似的图案和符号可能是一种探索途径。巴拉说：“人们也一直希望能在讨论当年发现经历的报纸或者手稿中发现更多的信息。但当时的人们只关注它可能是在19世纪经过处理的古物，而没有把焦点集中在石头本身、发现地土层的深度、有没有在附近发现什么东西、发现地距湖多远等问题上。所有这些问题至今仍是个谜。”