从出露硅化木树种的分布，赋生的的地质构造单元及地层，在某些方面可以推测出当时的古气侯变化，海陆变迁。

如银杏，它是我国特有的高大乔木，现今国外十分稀少，但在一亿多年前地球上银杏则广为分布，由于古气候的变化，地壳运动使银杏都埋入地下，部分形成硅化木化石。从银杏分布的一个侧面，反映出古气候的变化规律。

如水杉，在一亿多年前的上白垩纪时代，在北极圈广为分布，上白垩纪时代的北极圈气侯温和，不象今日冰雪覆盖，水杉石英硅化木常在该地域中出现。新生代中期气候、地质条件的变迁，水杉逐向欧州、亚州、北美扩展并称霸一时，又在这些地域留下无数的水杉硅化木化石，但到了第四纪大陆冰川密布，气候异常寒冷，欧州、北美水杉灭绝，水杉硅化木化石也不覆存在。但当时中国的第四纪冰川具分散、不连片特点，在沟谷中仍生长着，水杉逃过了冰川的刼难而保存到现代，这时的欧州、北美冰川连片分布，水杉失去了得以生存的环境而消亡，水