根的形态与繁殖方式也有密切的关系。用种子直播的茶树，主根明显，根系深，而无性繁殖的茶树，其根系由入土部分基部具分生能力的细胞分化而成，根群中有2～3条根向深处发展，逐渐形成为骨架根，其余多数根则向水平方向发展。经3～4年后，不管营养繁殖还是种子繁殖的茶树，其根系的外部形态就较难区分了。

茶树根系在土壤中的分布有明显的层次，最上展根群着生角度较大，分根性强，但因离地面近，易受环境条件的影响；下层根群着生角度较小，分根性弱，因离地面远，受环境条件影响较小。

根系的生长状态往往和地上部生长相对应，树冠的某一方位内枝叶量多，其对应部位根系的分布数量也较密。

根颈是茶树生理机能比较活跃、发育阶段较幼的部位。实生苗的根颈是由种子胚轴发育