一片小叶子支撑特色大产业 ——记安徽农业大学茶学教师团队
发布时间 2018-04-09 浏览 5814 次
具有注释功能的unigene,这些基因不仅为国际同行研究茶树生物学过程、次生代谢与调控、逆境响应等机理提供了大量生物学信息,而且为从转录组学揭示茶树乃至其它非测序物种的生物学问题提供了可靠的方法参考。首次报道的多条与茶树黄酮类物质、茶氨酸和咖啡碱等主要次生代谢物生物合成途径相关的新基因先后被国际知名综述类期刊Trends in Analytical Chemistry和Critical Reviews in Plant Sciences多次评述。

  以国家级茶树良种舒茶早为材料,完成了建库与测序,得到2267G原始数据,经过滤后得到的数据量为1393G。组装的scaffold的N50长度为347.1kb,组装的茶树基因组大小为2.98Gb。构建了覆盖茶树基因组大小10倍的BAC文库;与中国农科院茶叶研究所合作完成了茶树F1代150个单株的SNP遗传图谱构建,获得了6300个高质量的SNP。为茶树物理图谱构建、重要功能基因克隆、分子标记发掘、基因组学等研究提供了重要支持,并为公共基因数据库提供了1/3以上茶树转录组数据。

  坚持开放合作战略,培养国际化人才队伍

  近五年,

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