1990年代前半，首先是列入“小歇”等连锁泡沫红茶店的菜单，由于泡沫红茶店是咖啡店在台湾流行之前，上班族谈生意与学生聚会的热门场所，珍珠奶茶开始广受学生喜好。接着，在学校附近或补习班密集的地区、夜市等，逐渐出现珍珠奶茶的摊贩。

1990年代后期，有业者引进“自动封口机”取代传统杯盖。许多新的投资业者，如乐立杯、休闲小站、大联盟、快可各式珍珠奶茶成品(20张)立等，采用自动封口机开始拓展连锁外带饮料店业务。自此，外带式的珍珠奶茶店成为主流，也因为连锁店的参加，商人开始将珍珠奶茶拓展到全世界，成为台湾国际知晓的知名食物之一。 为了争谁才是发明珍珠奶茶,"春水堂"和"翰林茶馆"曾互相告到台湾法院。

提起珍珠奶茶，台中市是发源地，台中市民最早享受它迷人的滋味。1987年，台中市政府附近的茶馆首先推出珍珠奶茶，因口感Q软、搭配浓淡合宜的奶茶，滋味超优，原创者就是春水堂现任产品研发部经理林秀慧。林秀慧回忆着说，父母亲曾在菜市场摆摊做生意，她国小起假日必到菜市场帮忙，当时市场里让她印象最深刻的，就是一位「粉圆伯」，每天最期待的事，就是和哥哥分享一碗热热、粘稠且口感滑Ｑ的粉圆；从此嘴馋时， 她就会动手煮一锅粉圆解馋。

民国73年（1984年），林秀慧进入当时四维街、春水堂的前身的「阳羡茶行」从事吧台工作， 她学会调茶做饮料，尤其钟情奶茶，随后升任采购，到传统场采买时，看到「粉圆」总顺手买一包回店里，接着她尝试让粉圆与奶茶结合，一杯杯动人口感的珍珠奶茶就这样诞生。

初期，珍珠奶茶有如林秀慧的「私房茶」，只分享老板与同事，因大受好评，民国76年林秀慧升任四维店的店长时，想卖这款私房茶， 同事们于是一起动脑筋为茶饮命名，有人忽发奇想「奶茶里的粉圆一颗颗像珍珠般」，于是「珍珠奶茶」这个美丽名号就这样叫开了。

很快地，这款茶饮红遍台中市各泡沫红茶店，1个月后、整条四维街、市府路近大小红茶店，全部卖起珍珠奶茶。

有一度珍珠奶茶成台中饮品的特色饮品，外地民众到台中，必定来上一杯；3个月后更惊人，几乎全台都看得到珍珠奶茶身影，近年来更因台湾茶店拓展海外连锁，带着这款茶饮远征中国大陆、东南亚；目前欧洲与美洲都喝得到它，去年日本餐饮业者为了学「正统」的珍珠奶茶，还专程到台中市茶店取经，希望调制出台湾味的茶饮。

直到今天，虽然茶饮不断翻新，珍珠奶茶依然稳居各泡沫红茶店、茶摊与连锁店点单率前3名。