1949年，他应复旦大学校长陈望道之请，到复旦任茶学专业教授。还曾到安徽大学农学院和华中农学院任教，1954年始，在浙江农业大学任茶学系教授至退休。

　　庄晚芳在茶学及茶文化方面成就斐然，有不少为学界尊崇的著作，他于1956年编著的《茶作学》是中国现代茶树栽培学的重要专著。1957年他的《茶树生物学》出版，这是我国第一本系统论述茶树生物学特性的专著。书中率先对茶界长期论争不休的茶树原产地问题作了系统论证，批驳了关于茶树原产于印度的观点，科学推断云南是茶树原产地的中心。书问世20年后，当茶学界再次掀起考证茶树原产地的高潮时，庄晚芳又著《茶树原产于我国何地？》论文，作了进一步的翔实论述。此后，在茶学方面，庄晚芳妙论迭出，其中有著名的关于茶叶“愈采愈发”的观点；60年代初，关于将中国茶树区分为7个主要类型的意见等等，奠定了他作为一代茶学大家不可动摇的地位。

　　1989年，81岁高龄的庄晚芳提出了建立“中国茶德”的思想，引起社会各界很大关注，他将中国茶德概括为“廉、美、和、敬”四个字，这是他经过几年的思考作出的总结，充分体现了他的爱国之心和对中国传统文化的珍视。

　　“廉、美、和、敬”四字中，廉，是推行清廉，勤俭育德，以茶代酒，以茶敬客，减少洋饮料，节约外汇；美，美真康乐。名品为主，共品美味，共尝清香，康乐长寿；和，和诚相处。清茶一杯，德重茶礼，搞好人际关系；敬，敬人爱民，清茶一杯，助人为乐，器净水甘。应用茶艺为茶人修养之道。庄晚芳后还专作《中国茶德颂》诗来推扬中国茶德。

　　庄晚芳曾多次专文考证过乌龙茶的来龙去脉和相关问题。他对于中国茶文化的推广更是不遗余力，在他的倡导下，杭州、厦门都相继建立了以弘扬茶文化为要旨的“茶人之家”，在海内外都有很好的影响。