1984年起，陈宗懋任中国农业科学院茶叶研究所所长。在任所长的10年间，他不仅继续着科研工作，还肩负起推进茶叶产业化的重任。为此，他跑遍了各地茶区，几乎只要有茶的地方就有他的足迹。一面宣传茶叶科学知识，一面将外界的先进管理经验介绍给茶区人民。10年中，茶叶所科研与开发都取得了很大的成绩，有29个研究课题和项目获国家和省部级奖励；组织召开了3次国际茶叶学术研究会。

　　20世纪90年代初，陈宗懋又开拓了茶园化学生态学研究新领域，从“茶树－害虫－天敌”三重营养关系间的化学通讯机制着手，明确了害虫定位茶树和天敌寻觅害虫的化学生态学机制，揭示了在一种植物上不同害虫诱发产生不同挥发性化合物以引诱各种天敌的现象，为寻求害虫防治新途径提供了理论依据。

　　从20世纪70年代起，陈宗懋院士多次向农业部等部门提出在茶叶中禁用高残留和剧毒农药，选用低毒、高效、低残留农药的建议。1996年和