生物因物种的不同、形成条件的不同及保存过程的不同使得化石有很多种类型，但从总的方面看无非是以下四种：

1.实体化石这是指生物体本身部分或全部被保存下来的化石。

按保存方式有这样一些类型，一是树脂保存，这主要是琥珀一类的化石，被保存的对象主要是古节肢动物；二是坑沼保存，如陷入泥炭沼和沥青坑的动物，被保存的对象主要是古陆生脊椎动物；三是冰冻保存，这类化石相对比较年轻，如西伯利亚冻土中的一些第四纪大型古脊椎动物；四是石化作用（详见“化石的形成”说明）；

按化石质地则有这样一些类型，一是“未变实体化石”，这类化石软体部分得到很好或较好的保存，如猛犸、一些琥珀、一些木乃伊化的化石。这类化石有着极高的研究价值。二是“微变硬化石”，这类化石软组织已经丧失，但留下了一些稍变性的硬组织部分（牙、甲壳、外骨骼等），另外生物体内原矿物质成分得以保留，虽经较弱的石化，但一些生物结构仍保存得比较完好。这类化石多是无脊椎动物如三叶虫、贝类等。三是“石化化石”（详细参见石化作用