这些困难可能包括：（1）需要专业知识，因此难于掌握；（2）由于自然的复杂性，不同的过程可能造成相同或类似的结果，同一个现象可能有不同的成因解释，因此成因问题易于导致争议；（3）科学和认识是发展的，因此成因分类体系里面的石种时时面临着被修改的危险。所以应该尽量避免采用成因来构建分类的主体格架。另外，奇石的成因性质虽说反映更本质的自然属性，但不是人们最关心的性质。

3．水石、山石和风成石及切磨石的这些产状，和奇石的表生形成成因有着密切的联系，但是并不能直接解释为成因。借用法律上“事实”和“真相”的区别（和钟石学的：））“产状”阐述的是“事实”，而“成因”阐述的是“真相”。“产状”不直接解释为“真相”，这似乎是个缺点，但在奇石分类时，它更是优点，因为“产状”是比“成因”更加表观清晰的特性