病原藻侵入植物组织后，生长健壮的茶树能够在受侵染组织下方长出一层木栓化防护组织，阻止继续侵染。但长势衰弱的茶树则缺乏这种防护能力。因此一切导致茶树生活力下降的不良环境，都会引起红锈藻病的严重发生。诸如土壤缺肥、碱性、通气不良或有硬土层、遮荫不足、干旱、渍水、采摘过度等等，都可能是造成茶树长势衰退，酿成红锈藻病严重发生的诱因。

防止这种病发生，重点是加强茶园栽培管理，对树势衰弱的茶园实行深耕改土，增施有机肥，提高土壤肥力，以增强茶树抗病能力。

第二是要搞好茶园灌溉、遮荫。对云南大叶种茶园，要种好遮荫树，但以间种山毛豆作为临时遮荫的茶园，不要让山毛豆生长超过二年，因为它是该病的中间寄主。

第三，病区在病害传播前（4—5月），雨后喷射0.2%硫酸铜液加0.1%肥皂粉或0.5—0.7%石灰半量式玻尔多液，对它们有很好的防治效果。英德一些茶场在深耕改土的基础上，用50%托布津1000倍液喷射也有良好防治效果。