与此同时，在保持直营店和加盟店始终维持1∶2的比例的前提下，孙丹威开始带着吴裕泰制定连锁加盟体系，其中对于加盟商的素质和资源、门店的选址以及装潢，都列明要求：在北京城中，每家吴裕泰连锁店之间的距离应该在1.5公里以上;另外，每个店面的面积必须在50平方米以上;资金不少于40万元。对此，“吴裕泰”收取2万元/年的品牌使用费，另外还要从特许加盟店的销售额中提取2%的管理费用。

为了更好的对连锁加盟店进行更统一的控制和管理，2001年年底，孙丹威借助“外脑”，吴裕泰与联想集团签订了总金额为100万元的关于为吴裕泰提供系统咨询、软件开发、业务培训和网络维护的信息平台的合作合同，吴裕泰正式实现信息化管理，每间门店都被纳入了计算机网络。

在邀请专业设计公司完成了对吴裕泰所有连锁店进行了重新设计与装修改造之后，善于借助“外脑”力量的孙丹威将更多的精力放在了与奥运对接的市场推广和培养上，专门聘请了专家团队，制订了奥运前、奥运中及奥运后的品牌提升方案。目前，其奥运村“中华茶艺馆”项目，已经完成了项目申报和茶馆整体设计。