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第二阶段是2000年-2005年,云南的珍稀濒危植物的绝大多数都在它们的生态系统中得到较有效的保护,而且它们中的95%种类都较好地迁地保存,包括有适当的居群数、有两个以上的迁地保护点载培和建立了科学的记录系统等;此外,也有20%的种类和一定数量的人工繁殖体回归到它们原来的生态系统中去。
第三阶段是2005-2010年,建立云南珍稀濒危植物就地保护的监测系统,对其威胁的一些重要因素得到解除;由于通过有效的管理和人工繁殖体的回归而使多数珍稀濒危物种在就地保护地有较大的居群;而且各种迁地保护点均能对珍稀濒危植物进行有效的保存。
上述各个阶段都要在保护、培育、引种、繁殖、合理利用珍稀濒危植物的基础上,大力发展生物产业,特别是绿色植物产业、药用植物产业、花卉产业等新产业,促进新兴产业的崛起和国民