1989年10月28日,吴觉农因病在北京去世,终年92岁。
1990年10月28日至30日,纪念吴觉农逝世一周年暨骨灰安放仪式、吴觉农学术思想研讨会在上虞举行。吴觉农墓建在风景秀丽的百官龙山,实现了他魂归故土的遗愿。