茶树种质资源是生产利用、品种创新和生物技术研究的物质基础，对茶叶生产和科学研究具有十分重要的价值和意义。重庆辖区及其三峡库区种茶历史悠久，历经几千年的繁衍，自然进化和人工选择，形成了十分丰富的茶种资源，为开展茶树育种工作奠定了基础。该项目通过对重庆区域茶树种质资源进行收集、鉴定，征集稀有珍贵资源入圃保存；同时，对收集材料中的表现较好材料进行评价鉴定，筛选出综合性状优良的材料，为进一步育成能满足茶叶生产需求的品种奠定基础；应用分子标记技术对茶树种质资源进行遗传多样性、亲缘关系、品种鉴别、遗传进化等方面的研究，为茶树种质资源有效保护、材料的快速鉴别提供了有效方法。