许多玛瑙带有裂纹，如炸裂纹、炸心纹、破裂纹等。炸裂纹和炸心纹是在玛瑙形成过种中因二氧化硅胶体向结晶质过渡时由于收缩速度的差异等因素的变化所引起的。破裂纹是在玛瑙形成之后，由于受到动力作用的影响而产生的。有的玛瑙裂纹从中心向四周放射，有的玛瑙中心有裂纹而外层无裂纹，有的则与此相反。

　　按颜色的差异，可以将玛瑙划分为红玛瑙、锦红玛瑙、蓝玛瑙、紫玛瑙、酱斑玛瑙、金黄玛瑙、胆青玛瑙（鬼面青）、白玛瑙、浆水玛瑙，以及五颜六色混在一起、磨光之后五彩缤纷、犹如彩虹的锦犀玛瑙等。不过对于一些毫无花纹的单色玛瑙，就不能视为玛瑙，而是玉髓。

　　按花纹或纹饰的差异进行划分，则玛瑙的品种更多。如漆黑颜色中带一丝白色的合子玛瑙、黑白或褐红色相间的截子玛瑙（Lace agate