1、建立适应市场经济体制的生态保护投入机制。要把生态环境保护纳入国民经济和社会发展年度计划，把生态功能保护区、自然保护区、生态示范区、农村污染控制示范工程、生态保护监管能力、以及生态监测站网的建设与运行费纳入各级财政预算，建立固定的生态保护资金渠道；按照事权划分的原则，坚持多渠道、多层次、多方位筹集保护资金。对资源开发造成的生态破坏，必须坚持由开发单位或个人投资重建和恢复。

　　2、运用市场机制积极推进生态保护相关产业的发展。抓紧建立生态农业、有机农业、生态恢复科技咨询和技术服务体系，引进市场机制，鼓励走公司加农户的产业化发展道路；“十五”期间要以农业有机废物和城市有机垃圾资源化为重点，扶持一批产品和企业，加速农村环境保护产业的发展。

　　3、按照“谁使用谁付费”的原则，开展试点工作，探索建立以资源开发补偿、流域补偿、遗传资源惠益共享为主要内容的生态环境补偿机制。

　　（五）开拓创新，提高生态保护的科技支撑能力

　　1、重视生态保护的科研，加大投入。要把生态保护科学研究纳入各级科技发展的重点领域，给予重点扶持。鼓励科技创新，积极培养生态保护科研人才，不断提高生态保护的科技支持能力。

　　2、研究和开发重要生态保护理论与技术。尽快建立区域和流域生态环境与社会经济协调发展、生态系统方式、以及生态功能区划和生态影响评价的理论与方法；加强农村环境保护、生物多样性保护、生态恢复和水土保持等重点生态保护领域的技术开发和推广工作，组织示范工程。

　　（六）开展全民教育，增强生态保护的责任感

　　1、坚持不懈地开展生态保护宣传，进一步增强全民的生态保护意识和公德。要根据全国生态环境形势的变化和国家生态保护战略发展的需要，利用科学、艺术和新闻相结合的方式，定期开展生态环境警示教育；组织开展草原保护、森林保护、沙尘暴防治、水土保持和矿山环境保护、旅游环境保护等专题、专项宣传报道，不断提高公众的生态意识、环境意识和搞好生态保护的责任感、使命感。

　　2、进一步加强舆论监督，鼓励公众参与。表扬先进典型，揭露破坏生态的违法行为；完善信访、举报、听证和公示制度，鼓励公众和非政府组织参与，充分调动广大群众保护生态环境的积极性。

　　3、开展农村环境保护专题宣传。今后五年，要把农民作为重点对象，以生产和生活环境保护为主要内容，配合国家重点污染治理工程，结合农业经济结构调整，在农村地区广泛开展生态环境保护宣传，普及环境保护知识，传授生态产业技术。

　　（七）认真履约，广泛开展国际交流与合作

　　1、认真履行生态环境保护的国际公约。搞好《生物多样性公约》、《国际湿地公约》、《联合国防治荒漠化公约》以及《生物安全议定书》的履约工作，完善国内的履约协调机制，形成合力；加强对各类履约相关问题的研究，提高国际公约谈判和履约的应对能力，维护国家的生态环境保护权益。

　　2、广泛开展多边和双边国际合作。积极引进国外资金和生态保护的先进技术与经验，推动我国生态环境保护工作的全面发展；进一步加强与联合国开发署、环境署、全球环境基金、世界银行和亚洲开发银行的联系，不断拓展合作的领域，增强我国生态保护的监管能力建设；把西部地区和贫困地区的生态保护作为国际合作的优先领域。

　　五、重点工程

　　“十五”期间，要以生态环境保护的基础建设、能力建设和示范工程建设为主，通过重点工程的实施，全面提升生态环境的管护水平，确保生态保护目标的实现。

　　（一）生态功能保护区建设工程

　　1、国家级。建设长江、黄河、辽河源头区，洞庭湖、鄱阳湖、三江平原洪水调蓄区，黑河流域、阴山北麓、塔里木河下游防风固沙区，长江、黄河上中游水土保持重点预防保护区，南水北调东线、中线源头水源涵养区，舟山渔场，秦岭等15个国家级生态功能保护区，遏制其生态功能的破坏形成基本管护能力。

　　2、省级。建设40个省级生态功能保护区，初步遏制这些地区生态功能的继续破坏并形成管护能力。

　　（二）生物多样性保护工程

　　1、自然保护区建设。新建国家级自然保护区50个，重点是西南、西北和东北地区，使之形成初步管理能力；已有国家级自然保护区基础设施的完善。加大对现有155个国家级自然保护区的建设力度，形成较强的管护能力；建设与国际接轨的国家级自然保护区示范区20个。

　　2、生物多样性与生物安全监管能力建设。编制6个重点领域工作方案、组建生物多样性监测网络、开展生物多样性评估、建立国家生物多样性数据库和信息协调中心与交换所；建立国家生物安全评估中心、重点实验室、全国生物技术与生物安全数据库，建立生物安全跟踪监测系统，形成监管能力。

　　3、建设野生动植物种保护繁育中心和重要野生遗传资源保护区15个。

　　4、重要湖泊湖滨带生态系统与功能恢复。在太湖、滇池、巢湖、洞庭湖、鄱阳湖、洪湖、白洋淀、青海湖、博斯腾湖开展湖滨带生态系统与功能恢复示范工程。

　　（三）农村面源污染控制工程

　　1、秸秆禁烧与综合利用。选20个重点省，开展秸秆机械还田示范工程、秸秆过腹还田示范工程、秸秆气化转化新能源技术示范工程、秸秆加工纤维板技术示范工程。

　　2、规模化畜禽养殖污染控制。重点在北京、上海、天津、重庆、石家庄、郑州、广州、南京、杭州、昆明、成都、合肥、济南、青岛、烟台、深圳、大连等17个城市的郊区和郊县，建立畜禽污水处理示范工程、畜禽粪便资源化示范工程。

　　3、病死禽畜及其污染物污染控制。按统一规划，合理布局的原则，在一些重点大、中城市建立病死禽畜及其污染物处理示范工程。

　　4、化肥、农药污染防治。重点在京津塘地区、珠江三角洲、长江三角洲地区，太湖、滇池、巢湖、淮河（安徽、河南部分），建立农药、化肥环境污染跟踪监控体系和污染控制示范区。

　　（四）生态示范区建设与管理工程

　　1、国家级生态示范区管理系统建设。建成国家级生态示范区建设试点管理网络和信息系统。

　　2、生态示范区可持续发展能力建设示范工程。重点支持生态省建设试点和验收命名的国家级生态示范区的规划更新、监测、监管能力建设和环境与经济协调发展示范工程建设。

　　3、生态示范区宣传教育与科技支持。开展宣传教育和管理人员、技术人才、农民科技培训，完善宣传、推广设施，建立科技单位技术依托和新科技推广机制。

　　（五）资源开发的生态保护与恢复工程

　　1、矿山生态环境恢复治理工程。选择重点老矿区进行生态环境恢复治理示范，对矿山损毁土地进行土地复垦和植被恢复，对矿渣、废石、尾矿等进行无害化处理和资源化利用，对矿区污水、废水进行综合治理，对矿山开发造成的滑坡、塌陷等次生地质灾害及水土流失进行监测和治理，以及实施必要的移民工程。

　　2、生态旅游示范。以人与自然和谐为指导，以旅游资源的合理开发，搞好旅游环境保护和提高旅游管护能力为重点，支持中西部地区设立20个生态旅游示范点。

　　（六）生态保护监管能力建设工程

　　1、基础建设。开展生态环境现状调查，建立全国生态环境现状数据库，编制全国生态功能区划和生态保护规划，建立全国生态环境保护管理信息系统。

　　2、生态保护监控能力建设。分别建立生态环境的预警监测体系、气候灾害监测体系、重点区域土壤监测网、重点区域和流域生态状况实时监控系统，以及重大生态破坏事故应急处理系统。