艾滋病病毒(HIV)、SARS冠状病毒(SARS-CoV)等病毒是引起烈性和新发传染病的病原体，严重危害人类的健康和生命安全。这两种病毒均属于包膜病毒，其进入细胞的过程由病毒包膜蛋白介导。该项目以HIV和SARS-CoV为对象，研究病毒包膜结构及其介导病毒进入靶细胞的分子机制，并以病毒包膜蛋白为药物靶点，建立高通量药物筛选方法，进行活性筛选，研发特异性阻止病毒进入的抗艾滋病和抗SARS药物，用于这一类烈性和新发病毒性传染病的防治。该项目在国际上首次发现SARS冠状病毒的包膜蛋白具有与HIV包膜蛋白相似的六螺旋束结构，并最先报道了抗SARS多肽及SARS-CoV进入靶细胞的分子机制：发现gp41的CHR区域包含多个功能区，首次用直接的实验证据挑战了流行多年的关于抗艾滋病药物T-20作用机制的传统模型，发现T-20抑制HIV与靶细胞融合的机制是靶向gp120和gp41的多个位点；建立了一套基于多肽的研究病毒包膜结构和病毒进入靶细胞作用机制的集成技术，首创了进行靶向gp41的HIV进入抑制剂高通量筛选的荧光免疫吸附分析法(FLISA)和鉴定该类药物的荧光天然凝胶